精子的形态、活力和DNA完整性都直接影响受精过程和胚胎发育。如果精子存在严重的畸形、活力低下或DNA碎片化严重，就算成功受精，也可能衍生出胚胎发育不良或着床失败。子宫内膜是胚胎着床的重要场所，其厚度、血流供应及免疫状态都对胚胎的成功着床起着关键作用。如果子宫内膜过薄或存在炎症、息肉等问题，可能会阻碍胚胎着床，促成移植失败。进一步说，子宫内膜的容受性也受到激素水平的影响，如雌激素和孕激素的平衡。免疫系统在胚胎着床过程中扮演着双重角色。
一方面，它需要识别并隔离外来物质；换个角度看，它也需要容忍胚胎的存在。例外环境中，母体的免疫系统可能会错误地将胚胎视为“外来物”而进行攻击，酿成胚胎无法顺利着床或早期流产。常见的免疫问题包括抗磷脂抗体综合征、抗核抗体阳性等。胚胎的染色体异常是触发试管婴儿失败的主要原因之一。高龄女性、有家族遗传病史的夫妇，以及曾经有过多次自然流产经历的患者，其胚胎出现染色体异常的概率较高。第三代试管婴儿技术可以通过筛查胚胎的染色体结构和数目，选择健康的胚胎进行移植，由此推进提高成功率。
激素水平的波动会影响卵巢的排卵功能、卵子的质量以及子宫内膜的准备情况。例如，多囊卵巢综合征、甲状腺功能异常等内分泌疾病，都会干扰正常的生殖过程。于是，在进行试管婴儿前，医生通常会对患者的激素水平进行全面评估，并根据具体情况调整促排卵方案。生活方式和环境因素也难以回避的是。吸烟、饮酒、肥胖、压力过大等不良生活习惯会降低试管婴儿的成功率。补充说明，长期暴露于有害化学物质或辐射环境中，也可能损害生殖细胞，影响胚胎质量。
由此，建议患者在备孕期间保持健康的生活方式，避免接触有害物质。尽管二代试管婴儿技术已经相当成熟，但不同医疗机构的技术水平和实验室条件仍然存在差异。先进的胚胎培养技术、精准的胚胎筛选方法以及经验丰富的医疗团队，都能显著提高试管婴儿的成功率。从而，选择一家设备先进、技术过硬的医院至关重要。